医院始建于1949年1月，是济宁医学院附属医院，也是全市唯一的集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的三级甲等综合医院，是本区域疑难重症救治中心和医疗协作网中心。近几年，先后获批为国家全科医生临床培养基地、脑卒中筛查与防治基地医院、高级卒中中心、国家药物临床试验机构、国家级住院医师规范化培训基地。
院区占地210亩，业务用房13.4万㎡，编制床位1399张，设73个临床、医技科室，在岗员工2440人，其中：正高级职称109人、副高级221人、中级698人，博士21人、硕士512人，享受国务院特殊津贴专家2名，市级突出贡献专家、拔尖人才15名，硕士研究生导师30名。现有省、市级重点专科18个，设有24个市级专业质控中心，31个市级医学会分会挂靠我院，承担国家级继续医学教育项目2项、省级20项，省适宜卫生技术推广项目4项。超声诊断技术处于国内领先水平，连续主办12届胎儿心脏超声诊断新进展国家级继续教育项目培训班，成为“胎儿心脏病母胎医学研究北京市重点实验室”多中心协作单位；介入诊疗技术已达到省内先进水平，并承办脑血管病介入治疗国家级继续教育项目。承担着济宁医学院、潍坊医学院、滨州医学院、泰山医学院等临床教学任务，与潍坊医学院联合成立研究生培训基地，30名专家被聘为硕士研究生导师，通过教育部临床医学专业认证。
拥有西门子炫速双源CT、GE 64排螺旋CT、GE 3.0T磁共振、美国瓦里安直线加速器、飞利浦平板DSA、飞利浦Q7高档心血管彩超、HST-302血液分析流水线、全套系列进口内窥镜系统等万元以上医疗设备2300余台（套），数字化手术室、ICU处于全省先进行列。
近年来，在市委、市政府和市卫计委的正确领导下，我院坚持以加快推进公立医院改革为导向，紧紧围绕“调结构、转方式，强内涵、树品牌，夯基础、保需求”的工作思路，抢抓机遇，创新实干，努力满足人民群众日益增长的医疗健康需求。2016年，完成门急诊125.21万人次、出院病人7.95万人次、各类手术2.03万例，同比分别增长13.6%、9.6%和20.7%，平均住院日为8.5天，保持了持续健康发展的良好态势。2016年在省卫计委发布的全省50家三级综合医院绩效综合评价中位列第22位。
医院大力实施科技兴院战略，高度重视科研创新和技术攻关，开展了心脏冠状动脉支架置入术，体外循环与心脏不停跳搭桥术，心脏与大动脉瓣膜置换术，复杂先心畸形矫治术，颈动脉内膜剥脱术；脑血管及综合介入诊疗术，支气管镜下治疗技术，经消化道内镜行粘膜下和隧道式病灶切除术及ERCP胆道取石术；腹腔镜、胸腔镜、神经内镜、关节镜、脊柱内镜已广泛应用于普外、腹外、胸外、泌尿外、妇科、小儿外、神经外及骨外科等专业领域，创新开展头-颈-心动脉CT一站式联合扫描成像等系列先进检查方法，多项技术填补了我市空白。
医院与首都医科大学宣武医院签署战略合作协议，建立远程会诊平台，加入中国卒中中心联盟，聘请国家“万人计划”科技创新领军人才吉训明教授为首席专家，获批国家卫计委脑卒中筛查与防治基地医院和高级卒中中心。与协和医院、北大一院、北医三院、宣武医院、朝阳医院、北京友谊医院、积水潭医院、阜外医院、天坛医院、齐鲁医院、省立医院、青大附院等建立技术协作关系，中国医师协会鲁苏豫皖地区疝和腹壁培训基地落户我院；与德国、荷兰、美国、英国、捷克、意大利、韩国及台湾等国（境）外知名医院建立了紧密的双向交流与合作关系；与以色列MATAT高级专家组织开展合作，积极引进国外智力和人才技术项目。
医院积极履行社会公益职责，拥有装备先进的“健康直通车”，承担着全市传染病防治和突发公共卫生事件应急救援重要任务，大力实施对口支援、托管帮扶、技术协作等“卫生强基工程”，加快推进分级诊疗和医联体建设。先后荣获卫生部爱婴医院、全省卫生工作先进单位、全省卫生系统职业道德建设先进单位、全省优质医疗服务单位、全省十佳诚信医院、全省学习型组织先进单位、全省职工最满意的医保定点医院、省级文明单位、山东省健康促进医院、全市行业作风建设先进单位等称号。
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