武汉脑科医院·长江航运总医院创建于1954年，是一所集医疗、教学、科研、预防保健、疾病防控于一体的现代化综合性三乙优秀医院，湖北省认定的第一所脑科医院，湖北省水上紧急医学救援医院，国家级基层胸痛中心，国家级卒中中心、武汉市高级卒中中心，湖北省、武汉市医疗保险定点医院，武汉市江岸区困难群众医疗救助定点医院，北京天坛医院、德国柏林医院的技术协作单位，武汉轻工大学附属医院，武汉大学医学院等多所医学院校的实习基地或教学医院，湖北省多个专业住院医师规范化培训基地。
医院开放病床818张，设有52个临床科室，42个专业，10个医技科室，39个专家、专科及多学科门诊，在职职工千余人（含长航疾控中心），具有中、高级职称技术人员320余人。武汉轻工大学硕士生导师13人，湖北中医药大学、武汉大学医学院兼职教授20余人。设置了武汉轻工大学-武汉脑科医院·长江航运总医院护理学系和康复科学系两个临床教学机构，获批湖北省政府学位委员会和湖北省教育厅省级研究生工作站1个。
神经外科是湖北省临床重点专科，神经内科、康复医学科、感染科是武汉市临床重点专科，骨外科、药学科、老年病科是武汉市临床重点建设专科。医院与中科院武汉病毒所合作建立了神经系统疾病资源库与联合实验室，是武汉医师协会神经外科医师分会主委单位。
脑科是医院的重点学科，是省、市级临床重点专科，拥有一支优秀的团队。依托于北京天坛医院和德国柏林医院的技术合作，率先在省内设立小儿神经外科、功能神经外科、卒中单元、神经介入科、神经康复等专科，率先联合多学科开设眩晕门诊、记忆门诊、睡眠门诊、头痛门诊、癫痫帕金森病等特色多学科专家门诊。现已成功开展涵盖颅内、椎管内所有部位的肿瘤显微手术，如脑干肿瘤、丘脑肿瘤、三脑室肿瘤、髓内肿瘤等以及颅内动脉瘤和脑血管畸形、顽固性癫痫、三叉神经痛、面肌痉挛、小儿先天畸形、颅脑外伤、高血压脑出血等各种手术，“卒中单元”以早期溶栓、血管介入、康复等治疗技术于一体。医院常年聘请北京天坛医院神经内、外科及神经介入、神经放射等20余名国内、外专家为客座专家，每月定期邀请北京天坛医院神经内、外科专家来院主持专家门诊，开展查房、手术、疑难病会诊及教学查房。
在国家发改委、德国联邦经济技术部、德中卫生组织的大力支持下，从2011年开始，医院与德国柏林医院开展了神经康复医学方面的全面合作，2017年，华中地区首个“GSOR—德中在线康复”项目启动，医院致力于用全新理念、一流技术、先进设备，融贯中、西医学，逐步构建成华中地区一流的、以神经康复为主体的、治疗康复一体化的康复医疗服务体系，充分彰显脑科特色。
医院重点学科还有骨外科、心内科、普外科、泌尿外科、呼吸内科、感染科、内分泌科、影像科等学科，先后在省内较早开展冠状动脉造影术、冠脉内支架置入术、心脏永久起搏器安装术、射频消融术、心脏再同步化治疗除颤器植入术，全髋膝置换术、断肢再植术、腹腔镜下胃肠肝胆胰手术、ERCP、消化内镜下各种诊疗、肿瘤放射介入、泌尿系统各种微创手术、支气管镜下各种诊疗、人工肝、血液净化、血液透析及滤过等医疗技术。
医院医疗设备齐全，拥有3.0Ｔ核磁共振、介入数字血管造影机、320排动态容积CT 、乳腺钼靶、G4 数字化X射线透视摄影系统、德国Zeiss和Lica手术显微镜、手术立体定向系统、德国神经内镜、神经导航仪、128导视频脑电系统、32导术中脑电监测系统、彩超系统、自体血液回收机、各种内窥镜、多台全自动生化分析仪、射频手术系统、腹腔镜、新型碎石机、高压氧舱等等适应三级甲等医院技术开展的一系列现代化医疗设备。
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